保険料自動振替貸付の契約は、生命保険料控除は使えない？

いいえ､大丈夫です。
いわゆる自動振替貸付の契約についても生命保険料控除の対象となります。ただし、後日返済しても､その返済した金額については支払った保険料に該当しませんからご注意ください。